防震的主要措施是：

電鏡室必須遠離鐵路，載重車道，大型沖床，鍛造、汽錘等振動源等;

房屋的結構設計至少應防七級地震，當配置統一空調設備時，機房.好另建、或采用離體結構，并考慮消音和減震等措施;

采用減震墊或增設電鏡的獨立基礎(防震座)，可依不同型號電鏡的實際需要做成適當面積的大塊或鋼筋混泥土實心結構基礎;

為防止電鏡冷卻水的振動，保持水壓，流速的恒定，可采用加長供水軟管或裝配減壓瓣來穩定水壓的辦法;

防塵

電鏡的根本效能在于他的高分辨率本領和高放大能力，影響分辨率放大，而又難于排除的主要因素就是樣品的污染，這種污染來自環境條件和電鏡本身，電鏡要求的潔凈等級至少應達到萬級，室內噪音小于60分貝

防塵的主要措施是：電鏡建筑事宜選擇在環境清潔，綠化較好的場所，應該避開多風沙，多煙塵，和有腐蝕性氣體污染的區域，實驗室工藝布置合理緊湊，盡可能減少潔凈室面積,在滿足工藝要求的前提下，室內層高高度盡量降低，減少換氣次數,在電鏡，切片，離心機室應有緩沖間,設置統一空調設備，要求盡量減少渦流

供電系統

電鏡對于電源的根本需求是輸入電壓和頻率的穩定性，電壓的突然波動必將引起儀器個電路系統的瞬間的不穩定，影響正常操作性能。當電壓波動較大時，容易產生故障而損害儀器。此外還要求供電系統避免產生干擾磁場，避免灰塵積聚，保證供電安全

電鏡室，確保電源線應由變壓器或配電室直接引出，形成專用電纜，切不可 與其他大功率電器設備合用電纜，且輸出功率大于電鏡輸入功率3-5kw，

接地電阻小于5-10Ω

供水系統

實驗室除常規用水外，電鏡(鍍膜機等)還需要在恒溫條件下才能穩定的運轉，應有“恒溫冷卻循環水系統”水溫為20±5°，水壓為2-5公斤/cm，流量3-5升/分

室內通風與溫度

電鏡要求環境溫度為20正負1，濕度7%一下

其他

實驗室應該常備防火器具，電路應設有火災探測器和報警器,實驗室外門應常閉，可安裝電鈴呼叫,實驗室應設置應急照明,管道出風口，應該平均分散,防蟲防鼠,電鏡實驗室平面工藝方案,一個完整的電鏡實驗室應包含：電鏡房/制樣室/離心機室/切片機室/暗室。